O Ensino Fundamental, que engloba as nove séries de uma etapa reconhecidamente relevante da Educação Básica, caracteriza-se pela responsabilidade na execução de um trabalho docente cuja meta é formar cidadãos autônomos e atuantes na sociedade.
Para tanto, é fundamental disponibilizar aos alunos o acesso aos recursos culturais relevantes, que abrangem tanto os conhecimentos historicamente acumulados quanto as questões contemporâneas, como a Ecologia e meio-ambiente, as discussões éticas relativas à igualdade de direitos, à dignidade humana e à solidariedade.
Assim, o Educandário Santa Maria Goretti organiza sua proposta pedagógica para essa etapa orientando-se através dos Parâmetros Curriculares Nacionais, segundo os quais os objetivos para o Ensino Fundamental são definidos em termos de capacidades cognitivas, físicas, afetivas, de relações interpessoais, de inserção social e de ordem ética e estética, visando a uma formação ampla e completa.
Desse modo, o Educandário Santa Maria Goretti busca promover a aprendizagem através da elaboração de projetos educativos, do planejamento sistemático das aulas, da reflexão da prática educativa, da análise criteriosa dos materiais didáticos utilizados, sempre respeitando a pluralidade e a diversidade cultural dos alunos, que são acompanhados constantemente, tanto em relação às suas necessidades pedagógicas quanto psicológicas e comportamentais.